临床上，过敏因素和胃食管反流引起的慢性咽喉炎相当普遍，一旦详细问诊后明确病因就可以选择相应的药物治疗。
过敏因素所致慢性咽喉炎通常可以选择氯雷他定片或者盐酸西替利嗪片。平时也要尽量避免一些过敏因素的刺激，尤其是二手烟、厨房油烟、潮湿环境中霉变灰尘等，有些人是对冷空气的刺激比较敏感，冬天出门就要戴好口罩，注意防寒保暖，同时要尽量避免张口呼吸。
胃食管反流引起的慢性咽喉炎，通常治疗要用质子泵抑制剂如奥美拉唑、泮托拉唑等，促胃动力药物如多潘立酮、莫沙必利等。日常饮食宜清淡，尽量不吃一些容易产气的食物如红薯、藕、土豆以及豆子之类。饭后也要适当活动，以利于胃内容物排空，减少反流引起的刺激。